Use of molecular markers for entomological diversity assessment and their application in population study of aphids

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Résumé

L'utilisation de marqueurs moléculaires est l'un des outils les plus importants en développement dans le domaine de la génétique des populations. Ces éléments doivent être pris en considération avant de sélectionner l'approche moléculaire la plus efficace aux questions et modèles ciblés. Diverses approches en termes de marqueurs moléculaires sont décrites en relation avec l’étude des populations de pucerons : le bar-coding, les allozymes, le polymorphisme de longueurs de fragments de restriction (RFLP), le polymorphisme de longueur de fragment amplifié (AFLP), l’ADN polymorphe amplifié aléatoirement (RAPD), l’ADN microsatellite (SSR, STR), les répétitions de séquences inter-simples (ISSRs), le polymorphisme nucléotidique simple (SNP), l'ADN mitochondrial (ADNmt). La synthèse des applications de ces méthodes à l'étude de populations des pucerons est présentée ainsi que les principaux facteurs affectant la diversité génétique des pucerons. Cette démarche vise à fournir une base pour la sélection des marqueurs moléculaires dans la génétique des populations aphidiennes. La connaissance approfondie des approches appliquées permettra l'étude de la diversité génétique de pucerons encore non/peu étudiés pour investiguer les aspects évolutifs au sein de ces espèces entomologiques.

Abstract

Molecular marker use is one of the most important tool in development in the field of population genetics from the last several years. These techniques are used to detect and exploit the DNA polymorphism among different individuals at species and/or population levels. Several molecular markers have been developed during the past few decades, and their various principles and procedures endow them different properties, according to which, some factors, such as time, cost, repeatability and difficulty, should be considered before selecting the most efficient molecular approach. We reviewed nine frequently-used molecular markers (barcoding, allozymes, restriction fragment length polymorphism (RFLP), amplified fragment length polymorphism (AFLP), random amplified polymorphic DNA (RAPD), microsatellite DNA (SSR, STR), inter-simple sequence repeats (ISSRs), single nucleotide polymorphisms (SNPs), mitochondria DNA (mtDNA)) to be applied to population study of aphids as well as factors affecting genetic diversity of aphid. We aim at providing a basis for the selection of molecular markers in population genetics and obtaining a comprehensive acquaintance of genetic diversity study of aphids for tracing their evolutionary history implicating enlightenments for further aphid control.

Pour citer cet article

A propos de : Jianqing Guo

A propos de : Zhenying Wang

A propos de : Frédéric Francis